香港動植物公園有1000多種植物，並在種植方面盡量使植物發揮本身的自然美態。大部份的品種都產自熱帶及亞熱帶地區。

公園的植物數量雖少，但卻已包括了外來及本地的主要品種，如松柏、無花果、棕櫚、桉樹、玉蘭、茶花、杜鵑及春羽等；而較罕有的植物則有水杉、福氏臭椿、克氏茶、葛量洪茶和金花茶；還有形態、葉形、樹皮及果實都非常獨特的南洋杉、旅人蕉、王棕及無憂樹等。此外，公園內經常散發著玫瑰、米仔蘭、九里香、桂花、山指甲及白蘭的陣陣幽香。從年頭到年終，洋紫荊、魚木、厚葉黃花樹、石栗和鐵刀木都會相繼開出美麗奪目的花朵。到了秋天，更有楓樹及落羽松增添秋色。遊人在小徑漫步時，便可以欣賞到這些附有標籤說明的樹木。

公園南部角落設有百草園，而灌木植物則集中在噴水池平台花園，該處經常都栽有色彩斑爛的花卉。

在公園東面邊緣的溫室種植了超過150多個本地及外來品種的植物，包括蘭花、蕨類植物、鳳梨科植物、攀緣植物和室內植物等。